重启

1859年（安政六年），在江户，土方岁三四处挑战其他道场。一天，他造访了一家名为“诗荣馆”的道场。诗荣馆的道场主人是近藤勇，他后来成为了新选组的队长。土方与近藤交手，却被近藤压倒性的力量彻底击败。为了超越近藤的实力，土方决定加入诗荣馆。几年后，近藤和其他诗荣馆成员申请加入罗士组——一个以护卫幕府为名成立的组织——并作为罗士组成员驻扎在京都。当时的京都是一个奇特的城市，来自日本各地、背景各异、动机不明的人们聚集于此，拥护幕府、反外、反幕府的势力混杂在一起，暗杀、阴谋和政治斗争层出不穷。之后，他与芹泽鸭的派系共同组建了壬生郎士组，以镇压那些企图推翻幕府的反外活动分子。芹泽鸭和近藤洋央纪担任壬生郎士组的领导人，芹泽派的土方岁三、山波一郎和新见锦担任副领导人。然而，士荣官派和芹泽派之间的权力斗争逐渐加剧，导致冲突频发且激烈。

在科学搜查成为主流的时代，本剧第三季再度回归，讲述以“文字线索”破解悬案的爽快推理故事。性格古怪、痴迷文字的头脑派刑警鸣海理沙（铃木京香 饰）长期在警视厅文书解读第6系工作，曾屡破疑案。但六年间搭档矢代朋（波瑠 饰）被调走、系长空缺，第6系面临废止危机。此时，精于管理、从未让部门亏损的精英官员陆奥日名子（黑岛结菜 饰）主动赴任成为新系长。面对年纪小却认真纯粹的新上司，理沙重新振作。性格迥异的两人组成新搭档，再次挑战一桩桩复杂未解事件，并在合作中逐渐成长。