漆黑的夜晚，一名间谍悄然潜入日本警方某机构，盗走了记载着各国谍报机构重要数据的绝密文件的绝密数据。日本警方和FBI探员赤井秀一（池田秀一 配音）旋即与间谍展开追逐。最后，逃亡者的车辆坠落悬崖。第二天，柯南（高山南 配音）和伙伴们来到东都水族馆观光，结果发现一名受伤的美丽女子（天海佑希 配音）。该女子处于失忆状态，身上的手机也破损无法使用。柯南等人答应要帮她恢复记忆，当他们七嘴八舌之际，藏在暗处的黑衣组织成员贝尔摩德（小山茉美 配音）冷冷地注视着这一切。在相处过程中，女子非凡的身手和奇怪的言行举止让灰原哀（林原惠美 配音）对其真实身份产生怀疑。刚刚还一派祥和的水族馆，沉浸在快乐之中的人们，根本会想到随着那名神秘女子技艺的恢复，自己马上就要被卷入黑暗组织的杀戮和混乱之中…… 

宇宙世纪0068年，星际旅行成为平常，过度膨胀的人口通过宇宙殖民通往其他星球。太空殖民地环绕地球，构成了不可分割的整体。在此期间，宇宙殖民城市SIDE3——穆佐自治共和国的议长吉翁·什姆·戴肯（津田英三 配音）针对独立于地球联盟政府之外的主题发表慷慨激昂的演说。谁知演说过程中他突然倒地，一命呜呼。在此之后，坚信扎比家族是谋害吉翁的幕后黑手的金巴·拉尔（茶风林 配音）接近了吉翁的儿子卡斯巴尔·雷姆·戴肯（田中真弓 配音），想尽办法令其避免仇家追杀。与此同时，妄图攫取穆佐自治共和国实权的副议长德金·索多·扎比则带领扎比家族加快了谋逆的步伐。不寻常的命运等待着这些善恶之人…… ©豆瓣

音楽会のソロパートに選ばれたチノ。特訓をお願いされたリゼは、人前で歌うことに慣れさせようとカラオケ大会を開催しますが、チノの練習というよりは、みんなで盛り上がってしまいます。緊張したチノは当日ちゃんと歌えるのでしょうか──!?