在未来的约500年后，人类社会高度发展，并已实现向外太空的殖民。而在这一过程中，新的危机威胁着人类的存在。此时此刻，托马斯·拉斯基（汤姆·格兰 Tom Green 饰）还只是一名殖民星球军事学院的学生，他与迪娜（Kat de Lieva 饰）、Sully（Masam Holden 饰）每日进行艰苦严苛的训练，在此期间他一面饱受神秘疱疹的困扰，一面又对战争的本质产生之一。日常与身为地狱伞兵的哥哥通话给他仅有的安慰。直到某天，哥哥战死沙场，托马斯的去留也到了决断时刻。这一夜，未知的外星生物入侵学院，造成巨大的伤亡。危难时刻，战场之神士官长降临……

曾几何时，普罗大众对明星的追捧已经从狂热到了变态乖张的地步。关注明星的住行起居、搜集相关资讯和物品已不足为奇，所有和明星沾边的东西都成为搜藏家追逐的目标，甚至连明星感染的病毒以及明星细胞培养的人造肉类也成为粉丝急于入手的珍奇宝贝。以此为契机，专门贩卖明星病毒的卢卡斯中心应运而生。粉丝们趋之若鹜，只为和心中的偶像做最亲密的接触与联系。面色苍白的希德·马什（卡赖伯·兰德里·琼斯 Caleb Landry Jones 饰）是卢卡斯中心的一名员工，他利用工作之便将明星的病毒传入己身，外出偷偷倒卖。                                                                      　　某天，红女星汉娜（Sarah Gadon 饰）患病不治身亡。不久前刚刚盗取汉娜病毒样本的希德突然发现，他的人生将因此发生翻天覆地的改变……

童年的一起突发事件，令彼得·帕克（安德鲁·加菲尔德 Andrew Garfield 饰）和父母生离死别。转眼彼得成为一名高中生，他偶然发现父亲的公文包，并从叔父本（马丁·辛 Martin Sheen 饰）处得到线索，于是启程前往奥斯库公司拜访父亲当年的合作伙伴——科特·康纳斯博士（瑞斯·伊凡斯 Rhys Ifans 饰）。在公司内四处寻找线索的彼得意外被蜘蛛咬了一口，回程途中他的身体发生奇异的变化。在康纳斯博士德引导下，彼得不断了解并发掘体内着超乎寻常的能力，喜怒哀乐，各种意想不到的事情迅速向他袭来。直到某日，他便成了影响深远的超级战士蜘蛛侠。

在上一集中，爱丽丝（米拉·乔沃维奇 Milla Jovovich 饰）救出了被冷冻的同伴们，众人在离开之际却被赶来的雇佣兵赶尽杀绝。T病毒使红皇后（Megan Charpentier 饰）的程序发生了错误，变得残暴嗜血的她想要杀死最后的人类毁灭地球。唯一能够阻止红皇后的只有爱丽丝一人。而此刻，失去了能力的爱丽丝却被保护伞公司囚禁在位于海底的秘密基地中。威斯克（肖恩·罗伯茨 Shawn Roberts 饰）通过病毒侵入了保护伞公司的系统，他放走了爱丽丝并告诉她，她是人类最后的希望，而为了拯救人类，他们必须冰释前嫌共同抵抗更强大的敌人。爱丽丝遇见了保护伞公司的前员工艾达王（李冰冰 饰），两人一路上奋勇杀敌结下了深厚的友谊。

童年的一起突发事件，令彼得·帕克（安德鲁·加菲尔德 Andrew Garfield 饰）和父母生离死别。转眼彼得成为一名高中生，他偶然发现父亲的公文包，并从叔父本（马丁·辛 Martin Sheen 饰）处得到线索，于是启程前往奥斯库公司拜访父亲当年的合作伙伴——科特·康纳斯博士（瑞斯·伊凡斯 Rhys Ifans 饰）。在公司内四处寻找线索的彼得意外被蜘蛛咬了一口，回程途中他的身体发生奇异的变化。在康纳斯博士德引导下，彼得不断了解并发掘体内着超乎寻常的能力，喜怒哀乐，各种意想不到的事情迅速向他袭来。直到某日，他便成了影响深远的超级战士蜘蛛侠。

21世纪末，人类的科技水平已高度发达，克隆人技术和宇宙航行早已实现，不再是梦想。与此同时，许多科学家仍孜孜不倦追索着人类起源的秘密与真相。通过对许多古老文明的考察与对比，科学家伊丽莎白·肖（Noomi Rapace 饰）和查理·赫洛维（Logan Marshall-Green 饰）发现，人类可能是来自一个遥远星系的外星人创造的。在Weyland公司资助下，他们乘坐维克丝（查理兹·塞隆 Charlize Theron 饰）所掌管的宇宙飞船普罗米修斯号前往那颗未知的星球。
经过对当地的考察，地球人的设想成功得到印证。可是他们贸然探查“神的秘密”的行为，也将自己引入万劫不复的深渊…